http://www.cobik.sirss Center odličnosti za biosenzoriko, instrumentacijo in procesno kontrolo PHP http://www.cobik.sinovice/kemicna-ekologija-v-slubi-varstva-rastlin-brazilske-izkunje Nacionalni inštitut za biologijo Vas vabi, da se udeležite predavanja: "Kemična ekologija v službi varstva rastlin: brazilske izkušnje", ki ga bo predstavil dr. Raúl Alberto Laumann iz Brazilske raziskovalne organizacije za kmetijstvo, EMBRAPA Predavanje bo potekalo v četrtek 9. maja 2013, ob 15.30 uri, v Biološkem središču, Večna pot 111, v Ljubljani, v predavalnici B2. Povzetek predavanja: Dr. Laumann bo predstavil raziskave s področja kemične ekologije, ki jih izvajajo na EMBRAPA inštitutu. Pomemben del delovanja inštituta predstavlja Laboratorij za semiokemikalije (Brasília, v osrednji Braziliji), kjer se osredotočajo predvsem na raziskovanje feromonov žuželk in njihove identifikacije, preučevanje odnosov med rastlinami in žuželkami, elektrofiziologijo žuželk, razvoj novih formul fitofarmacevtskih sredstev in drugo. Predstavljene bodo najnovejše raziskave s področja kemične ekologije in možnosti uporabe tega znanja pri razvoju metod kemičnega in biotičnega zatiranja škodljivih organizmov. V Braziliji so te metode pomembno prispevale k razvoju kmetijstva. Predavanje bo potekalo v angleškem jeziku. Vljudno vabljeni! Mon, 06 May 2013 11:31:45 +0200 http://www.cobik.sinovice/the-aptamer-technology-powerful-tools-in-basic-science-diagnostics-and-therapy Nacionalni inštitut za biologijo Vas vabi, da se udeležite predavanja: "The Aptamer Technology: Powerful Tools in Basic Science, Diagnostics and Therapy" ki ga bo predstavil prof. dr. Henning Ulrich, iz Univerze v São Paulu, Brazilija, Kemijski inštitut, Oddelek za biokemijo. Predavanje bo potekalo v ponedeljek, 29.4.2013 ob 15.00 uri, v Biološkem središču, Večna pot 111, v Ljubljani, v predavalnici B2. Povzetek predavanja: DNA and RNA aptamers interact with their target proteins with high selectivity, specificity and affinity. The SELEX method consists of iterative cycles of in vitro screening of a combinatorial oligonucleotide library containing to 1016 different molecules and possible secondary and tertiary structures for target binding followed by PCR amplification of selected sequences. Aptamer ligands can be developed against almost any target protein. Due to the wide spectrum of applications, these novel molecules are used in numerous pharmacological, clinical and industrial processes. In the beginning, RNA and DNA aptamers were identified which bind to proteins that naturally interact with nucleic acids or small molecules such as ATP. In the following years, the use of the SELEX technique was extended in order to isolate oligonucleotide ligands for a wide range of proteins of importance for therapy and diagnostics, such as growth factors (3), cell surface antigens, entire cells and even whole organisms. Recently, the use of in vitro selection methods have been extended to living organisms such as bacteria, trypanosomes and Plasmodium falciparum-infected erythrocytes. Moreover, since it became apparent that aptamers are capable to distinguish between little differences in cell surface-marker-proteins expressed by i.e. cancer cells, parasite-infected cells or stem cells in comparison to normal somatic cell, they have been developed into promising agents for diagnostic and therapeutic applications. In this talk, I will focus on new accomplishments of the aptamer technology, and demonstrate some examples from my own research. Predavanje bo potekalo v angleškem jeziku. Vljudno vabljeni! Tue, 23 Apr 2013 13:01:58 +0200 http://www.cobik.sinovice/dr.-gianfranco-diretto-bo-predaval-na-nib Dr. Gianfranco Diretto prihaja z Italijanske nacionalne agencije za nove tehnologije, energijo in trajnostni razvoj (ENEA), Raziskovalni center Casaccia, Rim (Italija). Predavanje bo potekalo v četrtek, 25.4.2013 ob 15.30 uri,v Biološkem središču, Večna pot 111, v Ljubljani, v predavalnici B2. Povzetek predavanja:Karotenoidi so sekundarni metaboliti, ki pri živalih sodelujejo pri preprečevanju številnih bolezni, vključujoč rak ter bolezni srca in ožilja. Pri rastlinah pa igrajo karotenoidi ključno vlogo kot fotosintetski pigmenti v listih, sekundarni metaboliti v sadežu in cvetovih ter prekurzorjih hormonov; od teh pa so trije (α-/β-karoten, β-kriptoksantin) prekurzorji vitamina A in zato igrajo temeljno vlogo pri človeški prehrani. V obdobju zadnjih 20 let smo naredili veliko zbirko paradižnikovih in krompirjevih transgenih rastlin, ki so obogatene z β-karotenom in imajo višjo celokupno koncentracijo karotenoidov. Od teh smo posebno pozornost namenili t.i. “zlatim” genotipom, med katere sodijo genotipi, kjer so v gomoljih krompirja sočasno izraženi trije geni bakterijskega izvora (CrtB, fitoen sintaza; CrtI, fitoen desaturaza; CrtY, likopen β-ciklaza), transgene rastline paradižnika s povečanim izražanjem likopen β-ciklaze (LCY-b), β-karoten hidroksilaze (CHY) ter obe transgeni različici.Profile vseh omenjenih bioloških vzorcev smo preverili na transkriptomskem (mikromreže, sekvenciranje naslednje generacije), metabolomskem (GC-/LC-MS) in fenomskem nivoju. Integracija profilov genskega izražanja z visokozmogljivo metabolomiko nam je razkrila do tedaj nepoznane korelacije med transkripti in metaboliti, denimo dinamike koregulacij zorenja sadežev oz. staranja gomoljev zaradi skladiščenja. Opazili smo izrazit vpliv nalaganja karotenoidov pri kinetiki zorenja sadežev, kar je verjetno posredovano s hormonom ABA in etilenom. Obogatitvena analiza genske ontologije nam je razkrila genske družine, ki v “zlatih” genotipih regulirane na specifičen način. Za vizualizacijo in napovedovanje učinkov pristopov metabolnega inženiringa na metabolizem cele rastline smo uporabili omrežja bioloških interakcij in korelacij. Te analize so razkrile osredno vlogo karotenoidov pri uravnavanju razvoja tako sadežev kot gomoljev. Analiza omrežij pa se je izkazala kot ustrezen pristop pri zasnovi in biološko obogatenih poljščin, saj nam je nakazala prisotnost pomembnih enot omrežja (avtoritet), ki bi lahko bili tarča prihodnjih opemenitenj rastlin.Predavanje bo potekalo v angleškem jeziku.Vljudno vabljeni! Mon, 22 Apr 2013 10:10:45 +0200 http://www.cobik.sinovice/zacel-se-je-biodownstream-technology-course-btc2013 Letošnjo delavnico, ki je že druga po vrsti, bo COBIK izvedel v sodelovanju z Avstrijskim centrom za industrijsko biotehnologijo ACIB (Austrian Centre of Industrial Biotechnology). Posebno priznanje strokovnosti delavnice pa je letošnje pokroviteljstvo ICGEB, International Centre for Genetic Engineering and Biotechnology. ICGEB je namreč mednarodna, neprofitna raziskovalna organizacija, ki neodvisno deluje že od leta 1994 in ima več kot 60 držav članic. Njena ključna naloga in poslanstvo je zagotavljanje znanstvenega in izobraževalnega okolja z najvišjimi standardi, pri čemer skrbi za usmerjanje v inovativno raziskovanje na področju ved o življenju v dobro držav v razvoju. S financiranjem raziskovalnih in izobraževalnih programov povečuje njihove neodvisne raziskovalne zmožnosti. S pokroviteljstvom ICGEB je COBIK tako ponovno dobil veliko javno mednarodno priznanje. Partnerstvo z ACIB pa COBIK in Ajdovščino, kjer COBIK ob svojem ustanovitelju BIA Separations koncentrira svoje biotehnološke potenciale, oblikuje v vedno pomembnejše in bolj prepoznavno biotehnološko središče. Letošnja delavnica bo izvedena v prostorih Morske biološke postaje v Piranu, tudi zato, ker je Nacionalni inštitut za biologijo eden od soustanoviteljev COBIK, Piran pa prelepa mednarodna destinacija, ki bo raziskovalce z vsega sveta gotovo navdušila. Tue, 16 Apr 2013 11:08:42 +0200 http://www.cobik.sinovice/predavanje-prof.-dr.-henninga-ulrich Povzetek: DNA and RNA aptamers interact with their target proteins with high selectivity, specificity and affinity. The SELEX method consists of iterative cycles of in vitro screening of a combinatorial oligonucleotide library containing to 1016 different molecules and possible secondary and tertiary structures for target binding followed by PCR amplification of selected sequences. Aptamer ligands can be developed against almost any target protein. Due to the wide spectrum of applications, these novel molecules are used in numerous pharmacological, clinical and industrial processes. In the beginning, RNA and DNA aptamers were identified which bind to proteins that naturally interact with nucleic acids or small molecules such as ATP. In the following years, the use of the SELEX technique was extended in order to isolate oligonucleotide ligands for a wide range of proteins of importance for therapy and diagnostics, such as growth factors, cell surface antigens, entire cells and even whole organisms. Recently, the use of in vitro selection methods have been extended to living organisms such as bacteria, trypanosomes and Plasmodium falciparum-infected erythrocytes. Moreover, since it became apparent that aptamers are capable to distinguish between little differences in cell surface-marker-proteins expressed by i.e. cancer cells, parasite-infected cells or stem cells in comparison to normal somatic cell, they have been developed into promising agents for diagnostic and therapeutic applications. In this talk, I will focus on new accomplishments of the aptamer technology, and demonstrate some examples from my own research. Lecture will be given in English. Fotografije s predavanja: Thu, 11 Apr 2013 14:18:00 +0200 http://www.cobik.sinovice/btc-2013-le-e-10-dni Od 15. - 19. aprila 2013 bo COBIKov Laboratorij za bioanalitiko, ki ga vodi dr. Matjaž Peterka, izvedel Biodownstream Technology Course. Udeležili se jo bodo strokovnjaki, raziskovalci in inženirji z vsega sveta. več Thu, 04 Apr 2013 11:27:33 +0200 http://www.cobik.sinovice/projektna-pisarna-preseljena-v-ajdovcino S 25. 2. 2013 je tudi projektna pisarna COBIK iz Primorskega tehnološkega parka preseljena v Ajdovščino. Združitev na isti lokaciji nam bo omogočala učinkovitejše delo, sama stavba pa odlične delovne pogoje. Zamenjali smo tudi telefonske številke in naslov za dostavo: Naslov: Tovarniška 26, 5270 Ajdovščina Telefon:05 85 00893 (poslovna sekretarka)05 85 00895 (PR) Mon, 25 Feb 2013 10:28:04 +0100 http://www.cobik.sinovice/objava-prenovljene-spletne-strani-cobik Na spletni strani poleg prestavitve Centra odličnosti in naših laboratorijev lahko najdete tudi vsebine posvečene CO BIK konferenci, ki se vsako leto odvija na Ekonomski fakulteti v Ljubljani. Vsebinska novost na spletni strani so med drugim tudi naši projekti. Lahko si ogledate naše: mednarodne projekte nacionalne projekte tržne projekte S pomočjo koledarja dogodkov smo naredili enostaven pregled nad vsemi dogodki v povezavi s Centrom odličnosti. Posodobili pa smo tudi sklop za mlade naravoslovce. Naredili smo pregledenejši seznam delavnic, na šolo pa se bodo mladi odslej lahko prijavljali kar preko obrazca na spletni strani. Tue, 15 Jan 2013 00:00:00 +0100 http://www.cobik.sinovice/cobik-na-sok-2013 Fakulteta za elektrotehniko v Ljubljani, ki je ustanovni partner COBIK, bo v dneh od srede, 30. januarja, do petka, 1. februarja 2013, izvedla 20. redni letni seminar Optične komunikacije, na katerega vabi vse strokovnjake, ki se zanimajo za napredek in novejše dosežke ter razvojne perspektive na področju optičnih komunikacij. V okviru letošnjega SOK bo v četrtek, 31. januarja, od 16.15. - 18.00 izvedena tudi brezplačna delavnica Optične tehnologije v COBIK, ki jo bodo vodili raziskovalci COBIK: Kdo potrebuje točen prenos takta po optičnem vlaknu?, Boštjan Batagelj, LSO, FE Sistem za točen prenos takta po optičnem vlaknu, Jurij Tratnik, CoBIK Evalvacija sistema za točen prenos takta, Primož Lemut, CoBIK Merjenje dolgotrajne stabilnosti prenosa takta po optičnem vlaknu s faznim detektorjem, Miha Leskovec, CoBIK Merjenje dolžine optičnega vlakna z FPGA, Rok Stefanič, CoBIK Mikropretočni fluorometer in njegove aplikacije v biosenzorik, Peter Krkoč, CoBIK Karakterizacija magneto-optičnih komponent, Uroš Dragonja, CoBIK Na delavnici bodo udeleženci spoznali, kako optične tehnologije uporabljati v različne namene, od telekomunikacij, obdelovanja signalov do biosenzorike. Na vseh teh področjih optične tehnologije, ki so sicer jedro raziskav Laboratorija za napredno instrumentacijo v COBIK, uporabljajo tudi raziskovalci drugih laboratorijev COBIK. Prijava na brezplačno delavnico. Prosim, da v komentarju navedete, če se želite udeležiti le te delavnice. Fri, 04 Jan 2013 15:19:41 +0100 http://www.cobik.sinovice/odpovedana-konferenca-napredne-tehnologije-za-nove-trge 13.00-13.15 Pozdravni nagovor, Rebeka Koncilja, direktorica CO BIK COBIK se je v treh letih razvil v prebojno raziskovalno ustanovo, ki na nekaterih raziskovalnih področjih dosega vrhunske rezultate. V tem času je vzpostavil učinkovito in funkcionalno svetovno mrežo sodelovanja. Je edini nacionalni center odličnosti, ki je vzpostavljen regionalno. Poleg raziskovalnih dosežkov, ki bodo predstavljeni v nadaljevanju, pa je COBIK tudi oblikoval investicijsko platformo, ki povezuje visokotehnološka podjetja z investitorji, edinstveni študijski program MBA, ki je namenjen zlasti raziskovalcem in razvojnikom, ter dodatno šolo za nadarjene naravoslovce, namenjeno najbolj zagnanim srednješolcem. 13.15-13.30 Povezujemo visokotehnološke podjetnike in investitorje, Mladen Dakić, Laboratorij za odprte inovacijske sisteme Raziskujemo inovativne koncepte držav in podjetij.Ožja ekipa s področja nove ekonomije smo 8 doktorjev in 7 mladih raziskovalcev, visoko kompetentnih za raziskave, prenos znanja in razvoj sistemov odprte inovativnosti, podjetništva, komercializacije, internacionalizacije in tehnoloških politik. Delamo za in z nacionalnimi ter mednarodnimi akterji inovativno-razvojnih ekosistemov. Razvijamo odprte razvojne modele za sonaravno rast.Razširjeno ekipo LOIS tvorijo raziskovalni in razvojni partnerji iz celega sveta, glavno vodilo je odličnosti v tistem, kar delajo in kar lahko naredimo skupaj. LOIS se fokusira v princip in deležnike odprte inovativnosti, kjer gre za sodelovalni model nove ekonomije. Podpiramo uporabno inovativnost.Podpiramo znanost in raziskovalnost, ki ustvarja nove funkcionalno učinkovite rešitve. Taki inovativni proizvodi, storitve ali procesi izboljšujejo kvaliteto življenja in s prodajo generirajo nova trajnostna delovna mesta. Povezujemo visokotehnološke podjetnike in investitorje.Preko naše sodelovalne e-platforme COINVEST iščemo najbolj vznemirljive visokotehnološke rešitev iz znanosti in podjetništva z globalnim tržnim potencialom, jih ostrimo in povezujemo s pametnimi strateškimi in finančnimi investitorji. Soustvarjamo +prebojE.Vodilo delovanja LOIS je: Razmišljati "odprto in na veliko", proučevati inovativnost družbe celostno, združevati izjemne potenciale, soustvarjati inovativne poslovne pristope za sonaravne razvojno-tržne preboje in vstopati na (več)milijardne trge. 13.30-14.00 Razvoj in uporaba tehnologij na področju bioprocesov in antibakterijskih učinkovin, dr. Matjaž Peterka, Laboratorij za bioanalitiko Laboratorij za bio-analitiko združuje raziskovalce na področju biologije, biotehnologije, kemijskega inženirstva in kemije. Poslanstvo laboratorija so bazične in aplikativne raziskave na področju biotehnologije z namenom razvoja biotehnoloških produktov. Poslanstvo temelji na interdisciplinarnem znanju, podrobnem poznavanje področja biotehnologije in izkušnjah pri prenosu znanja v prakso. V laboratoriju potekajo raziskave in razvoj na področju proizvodnih procesov proteinov, DNA, virusov in celic. Vzporedno z novimi tehnologijami za proizvodnjo razvijamo tudi senzorje in metode za karakterizacijo bioloških molekul in virusov. Znanje in izkušnje nam omogočajo razvoj bio-procesov na laboratorijskem, pilotnem in industrijskem nivoju. Vzporedno v laboratoriju raziskujemo in razvijamo alternativne antibakterijske učinkovine s poudarkom na bakteriofagih. 14.00-14.30 Z inovativnimi simulacijami k novim materialom in procesom, Tadej Kodelja, Laboratorij za sisteme z naprednimi materiali V okviru predavanja prikažemo načela modeliranja materialov in procesov na podlagi fizikalnega modeliranja in modeliranja na podlagi umetne inteligence. Modele postavljamo za procese ulivanja, vročega in hladnega valjanja ter različnih toplotnih obdelav za jekla in aluminijeve zlitine na nivojih od razvoja mikrostrukture do nivoja celotne procesne verige. Mehaniko trdnin in kapljevin sklapljamo s simulacijami elektromagnetnega polja. Kot primere prikažemo nekatere izmed elementov procesne verige v podjetju Štore Steel in pojasnimo načela avtomatske optimizacije na podlagi simulacij. Na koncu predavanja predstavimo raziskave, usmerjene v razvoj novih jekel, aluminijevih zlitin in epoksi smol, oplemenitenih z dodatki nanodelcev. V predavanju prikažemo sodelovanje LSNM z Laboratorijem za večfazne procese in Laboratorijem za raziskave materialov z Univerze v Novi Gorici ter industrijskimi raziskovalnimi skupinami v podjetjih Štore Steel in IMPOL. 15.00-15.30 Dovršeni elektronski sistemi na osnovi mikrovalovnih in optičnih tehnologij , dr. Jurij Tratnik, Laboratorij za napredno instrumentacijo Laboratorij za napredno instrumentacijo združuje raziskovalce iz univerze ter gospodarstva, raziskovalne prostore pa ima v Ljubljani in Solkanu. Specializiran je za razvoj elektronskih sistemov na osnovi mikrovalovnih in optičnih tehnologij. V prototipnih produktih je tako združeno znanje RF tehnike, vlakenske optike in elektronike, pri svojem delu pa raziskovalci razpolagajo s širokim naborom dovršene mikrovalovne in optične merilne opreme.Vrhunske rezultate je laboratorij dosegel z razvojem izredno preciznega sinhronizacijskega sistema, ki omogoča prenos sinhronizacijskega takta s kratkotrajnim in dolgotrajnim odstopanjem faze manjšim od 10 femtosekund. Razvoj sistema je potekal od ideje do industrializiranega produkta, ki se sedaj uspešno uporablja za sinhronizacijo linearnih pospeševalnikov delcev, uporaben pa je tudi na drugih področjih fizike in tehnike. Vstop je prost, prosimo pa vas za prijavo na podporaATcobik.si Napredne tehnologije za nove trge.pdf Mon, 10 Dec 2012 20:36:00 +0100